پلنت تصفیه آب و پساب پالایشگاه امام خمینی شازند به منظور بازیابی پساب های تولیدی با املاح بالا و نیز بهبود کیفیت آب ورودی به خطوط تولید آب DM در نظر گرفته شده است. این واحد شامل دو خط مجزا جهت تصفیه آب خام و پساب های تولیدی در پالایشگاه می باشد. خوراک خط اول، ترکیبی از آب های سطحی(سد کمال صالح) و آب چاه با ظرفیت نرمال 170 m³/h بوده و خوراک خط دوم مجموع پساب های حاصل از احیای خطوط DM و POLISHER، بلودان برج های خنک کننده و مقادیری آب خام با ظرفیت نرمال کلی 170 m³/h می باشد که با اضافه شدن جریان تغلیظ شده (Brine) واحد RO بخش اول به میزان حدودا 30 m³/h و  پساب حاصل از شستشو فیلترهای بخش مذکور به میزان حدودا 48 m3/h ، ظرفیت این خط حدودا 248 m3/h خواهد شد. جهت تصفیه متناسب با کیفیت سیال ورودی، در هر دو بخش از روش های نوین نمک زدایی (Reverse osmosis system) و سیستم های پیش تصفیه مناسب استفاده شده است. در فرآیند مد نظر جهت تصفیه آب خام از بروزترین سیستم های تصفیه فیزیکی و شیمیایی در صنعت آب مانند Clariflocculator (با کاربری انعقاد، لخته سازی و ته نشینی)، فیلتراسیون شنی، اولترافیلتراسیون (Ultra Filtration) و سیستم تصفیه پیشرفته (جداسازی به وسیله غشا- RO) استفاده شده است. در خصوص پلنت تصفیه پساب، امکان تصفیه و بازچرخانی آب با استفاده از آخرین تکنولوژی های روز دنیا، فراهم شده است. در این واحد، پساب های تولیدی به علت دارا بودن املاح و سختی بالا، با عبور از واحدهای تصفیه فیزیکی و شیمیایی مناسب مانند Clariflocculator (با کاربری انعقاد، لخته سازی و ته نشینی)، سختی گیری با تزریق Caustic-Soda Ash، فیتراسیون شنی به منظور کاهش کدورت، فیلترهای کربنی و اولترافیلتراسیون (Ultra Filtration)، وارد واحد اسمز معکوس به منظور کاهش TDS و بهبود کیفیت آب می گردد. آب تولید شده در هر دو خط، به منظور فراهم نمودن خوراک ورودی واحد های تولید آب DM پالایشگاه، در دو مخزن 500 مترمکعبی ذخیره و مورد مصرف قرار خواهد گرفت.